MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori 83 chromosome

Total Repeats: 3118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017375	GGT	2	6	4088	4093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017375	TAT	2	6	4136	4141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017375	TGG	2	6	4180	4185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017375	ATGC	2	8	4284	4291	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017375	TGG	2	6	4300	4305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017375	GTG	2	6	4416	4421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017375	ACC	2	6	4448	4453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017375	GGT	2	6	4461	4466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017375	A	7	7	4582	4588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017375	T	8	8	4602	4609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017375	AAT	2	6	4623	4628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017375	TGT	2	6	4895	4900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017375	AGT	2	6	5126	5131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017375	AAAAAG	2	12	5142	5153	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017375	C	7	7	5160	5166	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_017375	A	7	7	5180	5186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017375	A	6	6	7247	7252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017375	AG	7	14	7283	7296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017375	T	7	7	7305	7311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017375	CATGA	2	10	7383	7392	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017375	TAA	3	9	9251	9259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017375	ATAA	2	8	9643	9650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017375	TAA	2	6	9733	9738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017375	ATT	2	6	9752	9757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017375	T	6	6	9829	9834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017375	ATTC	2	8	9846	9853	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017375	ACA	2	6	9863	9868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017375	GAA	2	6	9881	9886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017375	T	6	6	12697	12702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017375	AGG	2	6	12703	12708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017375	GCTTT	2	10	13561	13570	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017375	T	6	6	13568	13573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017375	T	7	7	13629	13635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017375	ATA	2	6	13639	13644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017375	TTAA	2	8	13658	13665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017375	CA	3	6	16646	16651	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017375	CTG	2	6	16667	16672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017375	A	6	6	18241	18246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017375	AAACAC	2	12	18281	18292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017375	GCATG	2	10	22846	22855	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017375	TTTCTT	2	12	22925	22936	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017375	TGA	2	6	22970	22975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017375	A	6	6	22975	22980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017375	AAG	2	6	22995	23000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017375	T	6	6	25124	25129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017375	CTT	2	6	25136	25141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017375	ATTA	2	8	25245	25252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017375	A	13	13	25270	25282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017375	GTT	2	6	25344	25349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017375	TAG	2	6	25467	25472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017375	CAT	2	6	25483	25488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017375	A	6	6	25638	25643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017375	GAGC	2	8	25667	25674	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017375	TGAA	2	8	25716	25723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017375	AAC	2	6	25739	25744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017375	AAG	2	6	25748	25753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017375	ATT	2	6	26034	26039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017375	CAT	2	6	26043	26048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017375	TC	3	6	29409	29414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017375	AAATT	2	10	30121	30130	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017375	TTA	2	6	30305	30310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017375	ATT	2	6	30318	30323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017375	CAT	2	6	30336	30341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017375	ATA	2	6	30404	30409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017375	T	6	6	30481	30486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017375	AGCG	2	8	30979	30986	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017375	T	6	6	31013	31018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017375	T	7	7	31073	31079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017375	T	6	6	39468	39473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017375	TTA	2	6	39498	39503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017375	T	6	6	39513	39518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017375	A	6	6	40997	41002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017375	TAT	2	6	41013	41018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017375	TTA	2	6	47057	47062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017375	TTA	2	6	51599	51604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017375	A	6	6	54166	54171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017375	TAA	2	6	54191	54196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017375	TGA	2	6	55225	55230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017375	AAT	2	6	55282	55287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017375	GTTA	2	8	55308	55315	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017375	AAC	2	6	57294	57299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017375	AAT	2	6	57311	57316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017375	GCCAA	2	10	57331	57340	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017375	AGCC	2	8	57341	57348	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017375	TGT	2	6	57404	57409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017375	TGAA	2	8	57431	57438	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017375	TAGA	2	8	57459	57466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017375	A	6	6	57475	57480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017375	TTCT	2	8	57503	57510	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017375	GTG	2	6	57525	57530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017375	TTTA	2	8	61524	61531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017375	TAAA	2	8	61560	61567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017375	AAG	2	6	65530	65535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017375	AAAG	2	8	65624	65631	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017375	T	6	6	65742	65747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017375	TTCA	2	8	65768	65775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017375	TGA	2	6	67391	67396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017375	TTAA	2	8	67405	67412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017375	TTA	2	6	72531	72536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017375	T	6	6	72604	72609	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017375	TAAT	2	8	72633	72640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017375	TAA	3	9	72739	72747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017375	ATTAT	2	10	72748	72757	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017375	TTAAA	2	10	72803	72812	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017375	ACAAA	2	10	72820	72829	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017375	G	7	7	73073	73079	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017375	ATA	2	6	73080	73085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017375	T	6	6	73124	73129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017375	GTG	2	6	73160	73165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017375	A	7	7	73193	73199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017375	C	7	7	73229	73235	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
112	NC_017375	AAT	2	6	73236	73241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017375	A	6	6	73284	73289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017375	AGA	2	6	73292	73297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017375	TC	3	6	73330	73335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017375	T	6	6	73349	73354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017375	A	8	8	73398	73405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017375	AGA	2	6	73429	73434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017375	CAA	2	6	73438	73443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017375	AGA	2	6	73450	73455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017375	ACTA	2	8	73465	73472	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017375	AGATAA	2	12	73474	73485	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017375	CTAA	2	8	73487	73494	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017375	CTGA	2	8	73508	73515	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017375	A	7	7	73515	73521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017375	AGAAAA	2	12	73537	73548	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017375	CGAG	2	8	74321	74328	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017375	GC	3	6	76222	76227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017375	AGA	2	6	77031	77036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017375	GAA	2	6	77041	77046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017375	TGC	2	6	77062	77067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017375	GAC	2	6	77104	77109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017375	ACA	2	6	77720	77725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017375	AGG	2	6	77862	77867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017375	TGA	2	6	77918	77923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017375	AG	3	6	77954	77959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017375	AGA	3	9	77972	77980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017375	TTA	2	6	77981	77986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017375	CTA	2	6	80105	80110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017375	CA	3	6	80127	80132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017375	AAG	2	6	80182	80187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017375	TTAG	2	8	80206	80213	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017375	AATA	2	8	80241	80248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017375	ATT	2	6	80331	80336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017375	AAT	2	6	80378	80383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017375	TTA	2	6	80398	80403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017375	AACA	2	8	80422	80429	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017375	TAT	2	6	81494	81499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017375	ATT	2	6	81509	81514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017375	AGAT	2	8	81515	81522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_017375	T	6	6	222188	222193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_017375	CGCT	2	8	222208	222215	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
442	NC_017375	GA	3	6	222235	222240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
443	NC_017375	ATTCTT	2	12	227119	227130	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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445	NC_017375	T	6	6	227227	227232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_017375	AAG	2	6	227353	227358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_017375	GAT	2	6	227401	227406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
451	NC_017375	AG	3	6	227420	227425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_017375	A	6	6	235135	235140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_017375	TAC	2	6	235209	235214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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468	NC_017375	ATT	2	6	237840	237845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_017375	TAA	2	6	237847	237852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_017375	T	6	6	242509	242514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_017375	TTAG	2	8	242684	242691	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_017375	CTAG	2	8	242733	242740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
478	NC_017375	TAT	2	6	243185	243190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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